קינדל של אמזון תואם למספר סוגים של ספר אלקטרוני (ספר אלקטרוני), ועושה שימוש בסוגי הקבצים השונים בהתאם לנסיבות. ספרים אלקטרוניים שנרכשו באמצעות אמזון משתמשים בתבנית הקניינית של החברה, הכוללת מערכת הגנה על ניהול זכויות דיגיטליות, או DRM. קינדל לא תמיד מחייב אותך להשתמש בחומר המוגן בזכויות יוצרים, עם זאת, ומקבל פורמטים אחרים במצב נטול DRM.
AZW
אמזון השיקה את פורמט הספרים האלקטרוניים הקנייני שלה, המשתמש בקידומת ".AZW", במקביל לשחרור מכשיר הקינדל המקורי. הפורמט משתמש בצורה משלו של הגנת DRM כדי למנוע גניבת זכויות יוצרים. זה מאפשר את כל צורות העיצוב של הטקסט וכולל אספקה לאיורים ותמונות שער בתוך הספרים האלקטרוניים. ההצלחה של מכשיר הקינדל גרמה לפורמט AZW לעלייה דרמטית בפופולריות. זה נתמך כעת על ידי שורה של תוכנות וקריאה אלקטרונית שונות מלבד קינדל.
MOBI ו- PRC
הפורמט של הספר האלקטרוני של Mobipocket מסומן על ידי הקידומת ".MOBI", הניתנת להחלפה לסוג הקובץ ".PRC" שאהוב במקור על ידי מגוון מכשירי ה- Palm Pilot PDA. הפורמט הקנייני של קינדל מבוסס על תקן Mobipocket אך שונה בשיטת הגנת זכויות היוצרים שלו. ספרים אלקטרוניים של MOBI מאפשרים עיצוב טקסט, תמונת כריכה וסימניות אלקטרוניות. אחד מהפורמטים הארוכים ביותר של ספרים אלקטרוניים, MOBI הוא אחד מסוגי הספר האלקטרוניים הפופולריים ביותר ונתמכים באופן נרחב. קינדל לא מצליח להשתמש בקבצי MOBI המוגנים על ידי DRM, אם כי אמזון מחזיקה כעת בחברת Mobipocket.
במקור הקינדל לא תמך בסוג הקובץ הפופולרי של Adobe של מסמך PDF. מאז נוספה תאימות באמצעות עדכון תוכנה, אם כי תאימות זו מוגבלת לגרסאות פשוטות מסוג המסמך הפתוח. מסמכי PDF מכילים לרוב גרפיקה מורכבת, עימוד ופונקציונליות אינטרנט שה- Kindle לא מצליח לפתור, אם כי ניתן להציג את רוב המסמכים מבוססי הטקסט בדיוק סביר. אפילו דגם Kindle האחרון עדיין נושא את האזהרה שתמיכת PDF היא ניסיונית וייתכן שהמסמכים לא יוצגו כהלכה.
טקסט
קבצי טקסט רגילים - המסומנים על ידי סוג הקובץ ".TXT" - נתמכים באופן מלא על ידי קינדל ויש להם יתרון ביצירת גדלי קבצים קטנים מאוד ותמיכה כמעט אוניברסלית במחשבים והתקנים ניידים. החיסרון בתצוגת ספרים אלקטרוניים בפורמט TXT הוא היעדר אפשרויות עיצוב טקסט ואין תמיכה במסמך בהערות, איורים או תכונות אינטראקטיביות. קינדל מסוגל להוסיף סימניות משלו לקבצי TXT, עם זאת, ולהבטיח שהקבצים הם עדיין אפשרות שימושית ומעשית לספרים אלקטרוניים.